No entiendo muy bien lo que quieres decir. Evidentemente cada CPU tiene su juego de instrucciones particular. A estas instrucciones se las denominan códigos de operación (opcodes)
En el caso de una CPU AMD o Intel el juego de instrucciones que tienen son equivalentes ya que ambas son CPU de arquitectura x86 (salvo los Intel Itanium).
En el caso de otras CPU como los ARM, PowerPC, MIPS o las CPU con arquitectura SPARC, los opcodes son totalmente diferentes.
La BIOS es un chip ROM o EPROM con las intsrucciones básicas patra inicializar el sistema y cargar el sector de arranque del dispositivo que esté configurado como primario o como "de aranque". Evidentemente las instrucciones de la BIOS están en el formato de instrucciones de la CPU en la que se ejecutará su programa interno. En la arquitectura IBMPC, la que usamos casi todos, el código de la BIOS es cargado en memoria (la dirección según Wikipedia es F000:FFF0) y luego se le envía al micro una señal para poner su contador de programa a esa dirección para que comiece a ejecutar lo que está cargado.
No sé si esto que te digo responde a lo que estabas preguntando.
Salud2.