Hola.
No entiendo bien la pregunta. Los flip-flops JK se conectarán de forma asincrónica o sincrónica dependiendo que es lo que quieras hacer y como.
Por ejemplo para armar un contador, sea progresivo o regresivo, podes usar FF JK conectados de una forma u otra.
La ventaja de la conexión asincrónica es que el circuito resultante queda muy simple, pero tenes mayores tiempos de respuesta.
En cambio en una conexión sincrónica, el circuito resultante llevará alguna que otras compuertas para controlar la secuencia de conteo, y lo bueno es que podes programar cualquier secuencia y no sólo una ascendente o descendente de uno en uno.
¡Salut!