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Resulta que es un choque elástico unidimensional. (A mi parecer)
No, con ese aporte de 16J la energía inicial es distinta de la final.
y estoy utilizando esta fórmula:
Son fórmulas correspondientes a un choque elástico.
¿Estaría bien usar esta fórmula? y ¿en qué lugar puedo poner los 16 (J) de energía liberados?
No. Si el procedimiento aprendido es aplicar fórmulas a ciegas

tenés que usar las correspondientes a un choque inelástico donde las masas quedan unidas y se pierden 16J.
Aunque lo recomendado es que prendas fuego a esas tablas y plantees directamente:
\( \left\{ \begin{array}{c} E_f&=& E_i+16J &\;\;\longrightarrow\;\; & \frac{1}{2}\dfrac{m}{2} V_1^2+ \frac{1}{2}\dfrac{m}{2} V_2^2 &=& \frac{1}{2}m V_0^2 +16J \\ p_i& =& p_f & \;\;\longrightarrow\;\; & m Vo &=& \dfrac{m}{2}V_1+\dfrac{m}{2}V_2 \end{array}\right. \)