Hola.
Para saber cuál es la más parecida, se requiere un criterio de semejanza. No sé cuál es el que manejas, pero los que yo he visto se implementan utilizando programación dinámica; puedes probar por ahí. El programa luego es trivial. Para cada línea del archivo, comparas la semejanza entre esa línea y la que necesitas, y te fijas si es mayor o no a la que llevas recordada. Luego memorizas la correcta.
P.D.: Python tiene un método para iterar por líneas usando un for.
Saludos.