Si quieres escribir una palabra en tamaño \scriptsize, la forma correcta es escribir
{\scriptsize La palabra}
Nota que las llaves son imprescindibles, porque si escribes \scriptsize sin llaves todo lo que sigue tendrá ese tamaño de letra. Puedes solucionarlo poniendo las siguientes llaves
{
\scriptsize{\underline{\textbf{Instrucciones:}}} \hspace{0.5cm} $ \bullet $ \scriptsize{ \textbf {NO HAY CONSULTAS.} Las respuestas sin desarrollo o sin justificación, no dan puntaje.} \\
\textcolor{white}{.} \hspace{2.4cm} \scriptsize{ $ \bullet $ Conteste de forma ordenada} \\
\textcolor{white}{.} \hspace{2.4cm} \scriptsize{ $ \bullet $ Queda prohibido el uso de calculadoras progamables, formularios y apuntes} \\
\scriptsize{ \textbf{Nota$=$}$ 1+ \displaystyle\frac{Puntos}{10} $.} \hfill \scriptsize{ \textbf{Duración$ = $}110 min $ + $ 10 min para enviar} \\
}
Obviamente, bastaría dejar sólo el primer \scriptsize y borrar el resto.
Por lo demás, hay varios detalles que puedes automatizar para próximas ediciones de listados de ejercicios. Por ejemplo esas tablas, puedes darle ancho fijo a cada columna, y en el ambiente enumerate no es necesario que coloques el número de cada pregunta, si no colocas nada se enumeran solas en orden. Además, esos colores que \color[HTML] puedes quitarlos, no parecen estar haciendo nada.
P.D. Olvidé mencionar, está muy bonito el resultado de pdf.